Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYTL3Q4VX76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms