Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFNL1Q499Z3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFNL1Q499Z3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFNL1Q499Z3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms