Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LONRF3Q496Y0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms