Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01559Q495D7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms