Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms