Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM71Q2Q1W2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM71Q2Q1W2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms