Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFX7Q2KHR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX7Q2KHR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms