Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTL8BQ17RB0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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