Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA3Q16787 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA3Q16787 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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