Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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