Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NTRK3Q16288 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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