Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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