Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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