Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RYR3Q15413 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RYR3Q15413 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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