Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms