Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF4Q15306 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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