Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDGFRLQ15198 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRLQ15198 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms