Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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