Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX17Q15036 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms