Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCAPD2Q15021 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPD2Q15021 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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