Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO1Q147U7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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