Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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