Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC2Q13753 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC2Q13753 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms