Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTM1Q13496 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTM1Q13496 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms