Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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