Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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