Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLF1Q13351 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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