Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKP2Q13309 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SKP2Q13309 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SKP2Q13309 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SKP2Q13309 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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