Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MKRN3Q13064 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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