Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFX1Q12986 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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