Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRJQ12913 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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