Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFEMP1Q12805 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFEMP1Q12805 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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