Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 BCH1YMR237W 2175 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 TFA1YKL028W 1449 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 YDR442WYDR442W 393 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 ARD1YHR013C 717 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 MMM1YLL006W 1281 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 YMR084WYMR084W 789 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 OPY1YBR129C 987 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 AGA1YNR044W 2178 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 MSR1YHR091C 1932 nt3.05□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 IOC3YFR013W 2364 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 PRS5YOL061W 1491 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 RPL30YGL030W 318 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 INA17YPL099C 549 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 SUI3YPL237W 858 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 ECM2YBR065C 1095 nt3.04□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 YDR089WYDR089W 2610 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 VAC17YCL063W 1272 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 HMLALPHA1YCL066W 528 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 MATALPHA1YCR040W 528 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 YVH1YIR026C 1095 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 JLP1YLL057C 1239 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 COS3YML132W 1140 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 YGK3YOL128C 1128 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 COS2YBR302C 1140 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 UBP5YER144C 2418 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 SMI1YGR229C 1518 nt3.03□□□□□ -1.92
RTR2Q12378 ARO1YDR127W 4767 nt3.03□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 ROK1YGL171W 1695 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 NUP60YAR002W 1620 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YDR271CYDR271C 372 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 REV7YIL139C 738 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 GTT2YLL060C 702 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 RPN13YLR421C 471 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 RIB4YOL143C 510 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 BUD21YOR078W 645 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YPR077CYPR077C 372 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 CKS1YBR135W 453 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 VPS53YJL029C 2469 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 GAS5YOL030W 1455 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 BCH2YKR027W 2298 nt3.02□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 CCT7YJL111W 1653 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 KDX1YKL161C 1302 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 VTA1YLR181C 993 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 HAL1YPR005C 885 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YBR300CYBR300C 498 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 IBA57YJR122W 1494 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 STP2YHR006W 1626 nt3.01□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 RPA135YPR010C 3612 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SUP45YBR143C 1314 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SPT10YJL127C 1923 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YAL004WYAL004W 648 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YNL165WYNL165W 1221 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 CEX1YOR112W 2286 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 HFD1YMR110C 1599 nt3□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 CDH1YGL003C 1701 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 TFB2YPL122C 1542 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 FUN12YAL035W 3009 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YDR090CYDR090C 933 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 RPS21BYJL136C 264 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 EMG1YLR186W 759 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 POC4YPL144W 447 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 GPI13YLL031C 3054 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 OMS1YDR316W 1416 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 DRS2YAL026C 4068 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 ENT1YDL161W 1365 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SKN7YHR206W 1869 nt2.99□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YRB30YGL164C 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 CHS2YBR038W 2892 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 ARP10YDR106W 855 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YLL017WYLL017W 312 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 TAF3YPL011C 1062 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 TSC11YER093C 4293 nt2.98□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 FMP32YFL046W 624 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 GTT1YIR038C 705 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 TMA19YKL056C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 ELO3YLR372W 1038 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SEC14YMR079W 915 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 TPM1YNL079C 600 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 RPL20BYOR312C 519 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SNQ2YDR011W 4506 nt2.97□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 NAM9YNL137C 1461 nt2.96□□□□□ -1.93
RTR2Q12378 SLA1YBL007C 3735 nt2.96□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 ERG20YJL167W 1059 nt2.96□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 FOL3YMR113W 1284 nt2.96□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 YOR238WYOR238W 912 nt2.96□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 ATG32YIL146C 1590 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 TIF4631YGR162W 2859 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 ACK1YDL203C 1872 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 NDT80YHR124W 1884 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 RMD1YDL001W 1293 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 NOP6YDL213C 678 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 PEX10YDR265W 1014 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 RSM25YIL093C 795 nt2.95□□□□□ -1.94
RTR2Q12378 YIL175WYIL175W 318 nt2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms