Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 SPS2YDR522C 1509 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 AVT7YIL088C 1473 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YGL140CYGL140C 3660 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YCL068CYCL068C 783 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 FAD1YDL045C 921 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 HMX1YLR205C 954 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 ARG80YMR042W 534 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 AIM39YOL053W 1188 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MSD1YPL104W 1977 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 EMC1YCL045C 2283 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 XRS2YDR369C 2565 nt3.5□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 HCA4YJL033W 2313 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SPB4YFL002C 1821 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 GCN5YGR252W 1320 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SRO9YCL037C 1305 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 VPS53YJL029C 2469 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YPR022CYPR022C 3402 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YCL075WYCL075W 441 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YDR133CYDR133C 336 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MCM21YDR318W 1107 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YGL074CYGL074C 327 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 CLC1YGR167W 702 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 FOL2YGR267C 732 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SPC24YMR117C 642 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MED7YOL135C 669 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 DER1YBR201W 636 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 GPI13YLL031C 3054 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 UBX5YDR330W 1503 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MRH4YGL064C 1686 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 NUP159YIL115C 4383 nt3.49□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MYO3YKL129C 3819 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 NOP6YDL213C 678 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YAL065CYAL065C 387 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 IDP2YLR174W 1239 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 MCK1YNL307C 1128 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 VPS28YPL065W 729 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SCD6YPR129W 1050 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SPT6YGR116W 4356 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 GEM1YAL048C 1989 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 RRN6YBL014C 2685 nt3.48□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 HMS1YOR032C 1305 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 CHD1YER164W 4407 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 ROK1YGL171W 1695 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 RAD7YJR052W 1698 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 PHM6YDR281C 315 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YGL101WYGL101W 648 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 YPT7YML001W 627 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 SPS4YOR313C 1017 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 PPZ1YML016C 2079 nt3.47□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 CLB5YPR120C 1308 nt3.46□□□□□ -1.85
RRP42Q12277 BUD27YFL023W 2391 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 MRPL11YDL202W 750 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 SOP4YJL192C 705 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 MOH1YBL049W 417 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 PRX1YBL064C 786 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RIB4YOL143C 510 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 PSF3YOL146W 585 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 ERB1YMR049C 2424 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 POL1YNL102W 4407 nt3.46□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 ZDS1YMR273C 2748 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 AIM14YGL160W 1713 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 NSE3YDR288W 912 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 PDX1YGR193C 1233 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 COS8YHL048W 1146 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YML053CYML053C 639 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RPL18AYOL120C 561 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 MET16YPR167C 786 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YBR137WYBR137W 540 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YPK3YBR028C 1578 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 KRI1YNL308C 1776 nt3.45□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 URA2YJL130C 6645 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 ABD1YBR236C 1311 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RTS1YOR014W 2274 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YDR526CYDR526C 471 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 PEX21YGR239C 867 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YHI9YHR029C 885 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 TMC1YOR052C 453 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RAD2YGR258C 3096 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 SSM4YIL030C 3960 nt3.44□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RAD26YJR035W 3258 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RPS18AYDR450W 441 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 DUO1YGL061C 744 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 YGR219WYGR219W 342 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 FMC1YIL098C 468 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 MSA2YKR077W 1092 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 CDC73YLR418C 1182 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 RIM11YMR139W 1113 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 NIS1YNL078W 1224 nt3.43□□□□□ -1.86
RRP42Q12277 snR17asnR17a 333 nt3.43□□□□□ -1.86
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