Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 COM2YER130C 1332 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 CSR2YPR030W 3366 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 SDS23YGL056C 1584 nt4.18□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 RPS13YDR064W 456 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 PUG1YER185W 912 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 ARP1YHR129C 1155 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 EMC6YLL014W 327 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 SMA2YML066C 1110 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 KAR4YCL055W 1008 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 SSA2YLL024C 1920 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 YDR537CYDR537C 606 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 YAP5YIR018W 738 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 CMD1YBR109C 444 nt4.17□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 HOS1YPR068C 1413 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 STP4YDL048C 1473 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 RAD17YOR368W 1206 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 YCL023CYCL023C 348 nt4.16□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 MSE1YOL033W 1611 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 RAM1YDL090C 1296 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 PDR1YGL013C 3207 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 VPS36YLR417W 1701 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 SAM37YMR060C 984 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 YMR085WYMR085W 1299 nt4.15□□□□□ -1.74
TY1B-NL1Q12112 MNL1YHR204W 2391 nt4.15□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MPC54YOR177C 1395 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MSN2YMR037C 2115 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 GCD1YOR260W 1737 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 OSW7YFR039C 1533 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 LNP1YHR192W 837 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MPS2YGL075C 1164 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MPC3YGR243W 441 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 TIS11YLR136C 858 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YLR346CYLR346C 306 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MNN1YER001W 2289 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 STE11YLR362W 2154 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 SEC17YBL050W 879 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YOR385WYOR385W 873 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 SAP155YFR040W 3009 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 PHM6YDR281C 315 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 ASG7YJL170C 630 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 ANB1YJR047C 474 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 DDI3YNL335W 678 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YOR186WYOR186W 435 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 IZH3YLR023C 1632 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YRM1YOR172W 2361 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 TUL1YKL034W 2277 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 RBA50YDR527W 1320 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YDR222WYDR222W 1248 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 CDC11YJR076C 1248 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 RPL17AYKL180W 555 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YNL108CYNL108C 813 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 SLP1YOR154W 1764 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 ROK1YGL171W 1695 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 SCP160YJL080C 3669 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 DAL2YIR029W 1032 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MHO1YJR008W 1017 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 RPL6AYML073C 531 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 STP2YHR006W 1626 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 RTT10YPL183C 3042 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 GIN4YDR507C 3429 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-NL1Q12112 MNT4YNR059W 1743 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 SWR1YDR334W 4545 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 RPL13AYDL082W 600 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 MGM101YJR144W 810 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 YCL022CYCL022C 516 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 GYP7YDL234C 2241 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 PET54YGR222W 882 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 SFH1YLR321C 1281 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 FZO1YBR179C 2568 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 ARP8YOR141C 2646 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 AST2YER101C 1293 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 THP2YHR167W 786 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 RPS22AYJL190C 393 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 RHO5YNL180C 996 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 OSH2YDL019C 3852 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 TFC4YGR047C 3078 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 UGA3YDL170W 1587 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 LSM12YHR121W 564 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 YJL132WYJL132W 2253 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 SEC26YDR238C 2922 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 SNQ2YDR011W 4506 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 FMP25YLR077W 1752 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 PRM15YMR278W 1869 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 APL6YGR261C 2430 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 CNL1YDR357C 369 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 ERG28YER044C 447 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 AAD16YFL057C 459 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 SDH3YKL141W 597 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 RPL13BYMR142C 600 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 YSH1YLR277C 2340 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-NL1Q12112 VTC3YPL019C 2508 nt4.04□□□□□ -1.76
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