Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CGNL1Q0VF96 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CGNL1Q0VF96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms