Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF543Q08ER8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF543Q08ER8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms