Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLEQ07864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
POLEQ07864 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
POLEQ07864 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLEQ07864 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLEQ07864 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLEQ07864 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLEQ07864 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLEQ07864 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLEQ07864 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLEQ07864 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms