Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCL9Q07325 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCL9Q07325 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms