Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 RKM4YDR257C 1485 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PRP31YGR091W 1485 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 NUP85YJR042W 2235 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 NAT1YDL040C 2565 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PUB1YNL016W 1362 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 VMA22YHR060W 546 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 FOL3YMR113W 1284 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TPP1YMR156C 717 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 NCE103YNL036W 666 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 DHH1YDL160C 1521 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TGL3YMR313C 1929 nt3.13□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 GLO3YER122C 1482 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 MSW1YDR268W 1140 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 CDC12YHR107C 1224 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 POG1YIL122W 1056 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YIR040CYIR040C 333 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 MDM38YOL027C 1722 nt3.12□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PHO12YHR215W 1404 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PHO11YAR071W 1404 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 APM1YPL259C 1428 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 NRP1YDL167C 2160 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PRM2YIL037C 1971 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPL30YGL030W 318 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 MMS2YGL087C 414 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TYS1YGR185C 1185 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PXR1YGR280C 816 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 DLS1YJL065C 504 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PSR1YLL010C 1284 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPS28BYLR264W 204 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YPR015CYPR015C 744 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YBR134WYBR134W 402 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPN6YDL097C 1305 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RAD2YGR258C 3096 nt3.11□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 ARP4YJL081C 1470 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 LCB5YLR260W 2064 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 SPO1YNL012W 1896 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RRP1YDR087C 837 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TIM21YGR033C 720 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PET54YGR222W 882 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 CDC73YLR418C 1182 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 VAM10YOR068C 345 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 SUP45YBR143C 1314 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 LTV1YKL143W 1392 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 ARX1YDR101C 1782 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 VTC4YJL012C 2166 nt3.1□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 SOF1YLL011W 1470 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 SSE2YBR169C 2082 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 COS7YDL248W 1152 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 COS5YJR161C 1152 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YKR047WYKR047W 306 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TRI1YMR233W 681 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YNL013CYNL013C 378 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPS7AYOR096W 573 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PLP2YOR281C 861 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.09□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 STT4YLR305C 5703 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SET1YHR119W 3243 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 AIP1YMR092C 1848 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SNT1YCR033W 3681 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ERV14YGL054C 417 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YGL193CYGL193C 312 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RAI1YGL246C 1164 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 UPS2YLR168C 693 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 PRX1YBL064C 786 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MCK1YNL307C 1128 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YNL320WYNL320W 855 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ERG9YHR190W 1335 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SSL1YLR005W 1386 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 UBP10YNL186W 2379 nt3.08□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 TCM62YBR044C 1719 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RSC1YGR056W 2787 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 COP1YDL145C 3606 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 IES6YEL044W 501 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YHI9YHR029C 885 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YPT35YHR105W 645 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MRPL20YKR085C 588 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 VPS71YML041C 843 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ARO7YPR060C 771 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 BSD2YBR290W 966 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CNA1YLR433C 1662 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 FRE4YNR060W 2160 nt3.07□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 TMA108YIL137C 2841 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ENA2YDR039C 3276 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ENA1YDR040C 3276 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YDL176WYDL176W 2127 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MOB2YFL034C-B 864 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CNN1YFR046C 1086 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YGL082WYGL082W 1146 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YGR015CYGR015C 987 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 BAT2YJR148W 1131 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SIR1YKR101W 1965 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YLR402WYLR402W 192 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 KTR6YPL053C 1341 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 REC8YPR007C 2043 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ANT1YPR128C 987 nt3.06□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ULP1YPL020C 1866 nt3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms