Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN11Q06124 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN11Q06124 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms