Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP2Q03169 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFAIP2Q03169 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP2Q03169 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms