Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB1Q02818 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB1Q02818 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms