Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLOD1Q02809 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms