Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ID3Q02535 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ID3Q02535 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ID3Q02535 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ID3Q02535 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms