Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPEQ02224 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms