Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XPCQ01831 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
XPCQ01831 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
XPCQ01831 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
XPCQ01831 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
XPCQ01831 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
XPCQ01831 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
XPCQ01831 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XPCQ01831 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XPCQ01831 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XPCQ01831 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
XPCQ01831 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XPCQ01831 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XPCQ01831 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XPCQ01831 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
XPCQ01831 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XPCQ01831 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
XPCQ01831 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
XPCQ01831 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
XPCQ01831 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
XPCQ01831 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms