Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC42EP1Q00587 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms