Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL1Q00532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKL1Q00532 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms