Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms